Department of Clinical Chemistry

Permanent URI for this collection

Browse

Recent Submissions

Now showing 1 - 1 of 1
  • Item
    Detection of Mupirocin Resistant Gene and its Association with Some Virulence Factors among Staphylococcus aureus Isolates, Khartoum State
    (University of Khartoum, ) Luai Osman Ibrahim Marouf ; Naser Eldin Bilal
    Background: Pathogenicity of Staphylococcus aureus is due to the toxins, invasiveness and antibiotic resistance. Methicillin resistant Staphylococcus aureus (MRSA) was a major cause of nosocomial and community acquired infections in most countries. Therefore the main objective of this study was to detect the methicillin and mupirocin resistant genes (mecA and mupA) and its association with some virulence factors (Panton-Valentine leukocidin PVL and clumping factor A Clfa) genes among Staphylococcus aureus isolates in Khartoum State. Methods: This cross sectional descriptive analytical study was conducted at the Department of Microbiology, Faculty of Medical Laboratory Sciences, University of Khartoum during the period from 2014 to 2016. Three hundred and nine isolates of Staphylococcus aureus from various clinical specimens obtained from Khartoum Teaching Hospitals (Khartoum, Omdurman and Khartoum North). Identification of the isolates was based on cultural characteristics and reactions in standard biochemical tests. All the isolates were tested for the following antibiotics: oxacillin (1 μg), mupirocin (5 μg), mupirocin (200 μg), vancomycin (30 μg), linezolid (30 μg), penicillin (10 μg), ciprofloxacin (10 μg), gentamicin (10 μg) and chloramphenicol (30 μg) using disk diffusion technique as shown in the Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) guidelines. All isolated strains were tested for the presence of methicillin, mupirocin resistance and virulence factors encoding genes using PCR with specific primers for detection of mecA, mupA, PVL and Clfa genes. Data were analyzed using SPSS (Statistical Package for Social Sciences) software version 20. Proportion was compared using McNemer test and the significance was determined at the ≤ 0.05%. Results: Out of 309 isolates, the highest percentage of resistance 92.9% (n= 287) was found in penicillin, followed by oxacillin 57.9% (n = 179), gentamicin 17.2% (n= 53), ciprofloxacin 16.2% (n= 50), low level mupirocin 9.7% (n= 30), linezolid 7.4% (n= 23), chloramphenicol 2.9% (n= 9), vancomycin 1.6% (n= 5). High level mupirocin was the most effective antibiotic tested, with low resistance rate 1.4% (n= 4). Of the 30 isolates which showed low level mupirocin resistant 83% (n= 25) were also oxacillin resistant. All high level mupirocin resistant isolates 100% (n= 4) were oxacillin resistant. All isolates showed high susceptibility rate to high level mupirocin, chloramphenicol and vancomycin. The presence of mecA gene was confirmed in 177 (98.9%) of oxacillin resistant isolates. In addition, the presence of mupA was confirmed in all low and high level mupirocin resistant isolates 30 (100%). The PVL gene was detected in 187 (60.5%) isolates. The highest frequency of PVL gene in the isolates which were resistant to penicillin 55.66% (n= 172) and oxacillin 34.3% (n= 106) (P> 0.05). The Clfa gene was detected in 180 (58.25%) isolates. The highest frequency of Clfa gene in the isolates which were resistant to penicillin 54.05% (n= 167) and oxacillin 35.28% (n= 109) (P> 0.05). Conclusion: The prevalence of MRSA infections in Khartoum State Teaching Hospitals has become wide spread. Mupirocin resistance in Staphylococcus aureus isolates is still low. Vancomycin and linezolid are the best drugs for treatment of oxacillin and mupirocin resistant Staphylococcus aureus infections as shown in vitro testing. Furthermore, penicillin showed the highest percentage of resistance among MRSA and MSSA strains. The result of this study showed that there was no association between mupirocin resistant gene (mupA) and the virulence factors (PVL,Clfa). خلفيه: المكورات العنقوديه الذهبيه لها المقدره على التسبب بالامراض وذلك لمقدرتها على افراز السموم, غزو الانسجه ومقاومه المضادات الحيويه. المكورات العنقوديه الذهبيه المقاومه للميثيسلين لها دور كبير في التسبب بالامراض في المستشفيات والمجتمع في العديد من الدول. هذه الدراسه تهدف لتحديد انماط الحساسيه للميوبروسين في المكورات العنقوديه الذهبيه الحساسه والمقاومه للميثيسلين. وارتباطها بجيني مك ايه وميوب ايه ((mecA, mupA المسئولان عن مقاومه البكتريا للميثيسلين والميوبروسين. وتحديد علاقتها ببعض الجينات المسئوله عن العدائيه وهي البي في ال و السي ال اف ايه (PVL, Clfa) وهي مسئوله عن انتاج سم البانتون فلانتين و عامل التخثر ايه للمكورات العنقوديه الذهبيه المعزوله من المرضى بمستشفيات الخرطوم التعليميه بولايه الخرطوم، السودان. الطرائق: اجريت هذه الدراسة الوصفية التحليليه ذات اطار زمني محدد بقسم الأحياء الدقيقة الطبية, كلية علوم المختبرات الطبية, جامعة الخرطوم خلال الفترة من 2014 الى 2016. تم التعرف على ثلاثمائة وتسعه عزلة من المكورات العنقوديه الذهبيه من مختلف العينات السريرية التى تم جمعها من المستشفيات التعليمية بولاية الخرطوم (الخرطوم، امدرمان والخرطوم بحري). واستند تحديد العزلات على الخصائص المز رعية والتفاعلات الكيموحيوية في الاختبارات القياسية. تم اختبار جميع العزلات للمضادات الحيوية التالية؛ اوكساسلين (1 ميكروجرام)، ميوبيروسين (5 ميكروجرام)، ميوبيروسين (200 ميكروجرام)، فانكومايسين (30 ميكروجرام)، لينيزلويد (30 ميكروجرام)، بنسلين (10 ميكروجرام)، سبروفلوكزاسين (10 ميكروجرام)، جنتاميسين (10 ميكروجرام)، كلورامفينيكول (30 ميكروجرام), بواسطة تقنية نشر القرص وفقا لتوجيهات المعهد القياسى للمعامل السريرية (.(CLSI تم الكشف عن وجود الجينات المسببه لمقاومه الميثيسلين والميوبيروسين mecA, mupA)) والعوامل العدائيه (PVL, Clfa), في جميع السلالات المعزولة بتقنية سلسلة تفاعل البلمرة. تم تحليل البيانات باستخدام برنامج الحزمه الاحصائيه للعلوم الاجتماعيه الاصداره رقم 20 وتمت مقارنه النتائج باستخدام اختبار ماكنمر. النتائج :أظهرت الدراسة مقاومات مختلفة للمضادات الحيوية شائعة الاستخدام في المستشفيات لعزلات المكورات العنقوديه الذهبيه. وكانت على النحو التالي الاوكساسلين 75,9% (179 عزله) , الجنتاميسين 17,2% (53 عزله), السيبروفلوكساسين 16,2% (50 عزله), المعدل المنخفض للميويروسين 9,7% (30 عزله), الينوزولويد 7,4% (23 عزله), الكلورامفينيكول 2,9% (9 عزلات) و الفانكومايسين 1,6% (5 عزلات). المعدل المرتفع للميويروسين هو المضاد الحيوي الأكثر فعالية من بين المضادات التي تم اختبارها وهو الاقل مقاومه 1,4% (4 عزلات). أظهرت الدراسة من اصل 30 عزله من العزلات المقاومه للمعدل المنخفض للميويروسين ان هنالك 83% (25 عزله) مقاومه للاوكساسلين . كل العزلات المقاومه للمعدل المرتفع للميويروسين100% (4 عزلات) مقاومه للاوكساسلين. و من ناحية اخرى كل العزلات اظهرت ارتفاع معدل التأثر للمعدل المرتفع للميويروسين, الكلورامفينيكول و الفانكومايسين. تم التاكيد بعد اجراء التحليل الجيني على وجود جينه mecA في98,9% ( 177 عزله) مقاومه للاوكساسلين وكذلك تم تاكيد وجود جينه mupA في كل العزلات 100% (30 عزله) المقاومه للمعدل المنخفض والمرتفع للميويروسين. جينه PVL تم تاكيد وجودها في 60,5% (187 عزله) من العزلات. اعلى معدل تكراري لجينه PVL كان في العزلات المقاومه للبنسلين 55,66% (172 عزله) و للاوكساسلين 34,3% (106 عزله) (القيمه الاحتماليه < 0.05). جينه Clfa تم تاكيد وجودها في 58.25% (180عزله). اعلى معدل تكراري لجينه Clfa كان في العزلات المقاومه للبنسلين 54,05% (167 عزله) و للاوكساسلين 35,28% (109 عزله) (القيمه الاحتماليه < 0.05). الخلاصة: اظهرت الدراسه ارتفاع معدل انتشار المكورات العنقوديه الذهبيه المقاومه للمثيسلين في المستشفيات التعليميه بولايه الخرطوم. ولكن معدل مقاومه المكورات العنقوديه الذهبيه للميوبروسين منخفض. الفانكومايسين والينوزولويد هم الاكثر فعاليه في علاج الامراض التي تسببها المكورات العنقوديه الذهبيه المقاومه للمثيسلين كما اتضح من خلال اختبارات الحساسيه. اظهرت المكورات العنقوديه الذهبيه المقاومه والحساسه للمثيسلين معدل مقاومه عاليه للبنسلين. كما بينت نتائج الدراسه انه لا توجد علاقه بين جينه مقاومه الميوبروسين (mupA) وجينات العوامل العدائيه (PVL,Clfa).