University of Khartoum

Molecular Detection and Characterization of Human Papilloma Virus in Children with Focal Epithelial Hyperplasia in Khartoum State

Molecular Detection and Characterization of Human Papilloma Virus in Children with Focal Epithelial Hyperplasia in Khartoum State

Show simple item record

dc.contributor.advisor Isam El-khidir en_US
dc.contributor.author Agarof, Samira Munir Bolis
dc.contributor.other Microbiology en_US
dc.date 2015
dc.date.accessioned 2016-01-11T09:24:16Z
dc.date.available 2016-01-11T09:24:16Z
dc.date.issued 2016-01-11
dc.date.submitted 2016
dc.identifier.uri http://khartoumspace.uofk.edu/handle/123456789/18390
dc.description 64page
dc.description.abstract Background: Focal epithelial hyperplasia (FEH) is a common disease which appears in the form of symptomless benign oral cavity lesions caused by specific human papilloma virus (HPV) genotypes. It is seen worldwide specially among children and mainly in females than males. This study aimed to detect HPV and determine the genotypes assocciated with FEH in childern (three to fourteen years old). The PCR findings were compared to the Pap. stain results. Methods: This descriptive, analytical study was conducted at the Faculty of Dentistry, University of Khartoum and Khartoum Dental Teaching Hospital, Khartoum State, during the period from February 2012 to August 2014. Fourty seven oral biopsies and smears were taken from children (3-14 years old), who attended the pediatric dental clinics and were clinically diagnosed as FEH cases. DNA was extracted from the biopsies using a special tissue DNA extraction kit then polymerase chain reaction (PCR) was performed. Pap. stain was done for the oral smears. Results: Eleven samples (23.4%) were positive for the low risk genotypes 6/11, twenty samples (42.6%) were positive for genotypes 13/32 and twenty seven samples (57.4%) were positive for the high risk genotypes 16/31/33/35/45/52/58 and 66. Genotypes 18/39/56/59 were not detected (0%). Twenty seven samples (57.4%) were positive for more than one genotype. The most frequent genotypes which were detected were HPV 32 (16 samples were positive, 34%) followed by HPV 16 (12 samples were positive, 25.5%). HPV genotypes 31, 33, 35, 52, 58 and 66 were detected using the PCR technique in this study although they were not mentioned in the studies conducted in FEH at the level of the literature review. For the oral smears Papanicolaou (Pap.) stain was performed and twenty nine samples (80.5%) for PCR showed koilocytosis and mitosoid cells. Pap. Stain's sensitivity was 78.4% and 60% specific. Conclusion: The frequency and percentage of HPV genotypes assocciated with FEH was (2.1% – 34%). The percentage of the positive Pap. smears was 76.6%. There was a significant difference between PCR and Pap. Stain. The PCR was the gold (standard) method for diagnosis of FEH cases compared with the Pap stain. en_US
dc.publisher University of Khartoum en_US
dc.subject Molecular Detection and Characterization of Human Papilloma Virus in Children with Focal Epithelial Hyperplasia in Khartoum State en_US
dc.title Molecular Detection and Characterization of Human Papilloma Virus in Children with Focal Epithelial Hyperplasia in Khartoum State en_US
dc.type Thesis en_US
dc.Degree M.Sc en_US
dc.Faculty Medical Laboratory Sciences en_US
dc.description.arabic-abstract الخلفية: إن مرض فرط التنسج الظهاري البؤري من الأمراض الشائعة التي تظهر بدون اي أعراض و في شكل أورام حميدة في التجويف الفموي بواسطة أنماط جينية معينة لفيروس الورم الحليمي البشري. هّذا الداء موجود في معظم بلدان العالم و خاصة وسط الأطفال و هو أكثر شيوعا عند الإناث. هدفت هذه الدراسة الي تحديد الأنماط الجينية لفيروس الورم الحليمي البشري التي تصاحب داء فرط التنسج الظهاري البؤري في الأطفال من عمر ثلاث إلى أربع عشرة سنة. تمت مقارنة نتائج التفاعل السلسلي لإنزيم البوليميراز مع نتائج صبغة بابانيكولا. المنهجية: هذه الدراسة الوصفية التحليلية أجريت في كلية طب الأسنان, جامعة الخرطوم و مستشفى الخرطوم التعليمي للأسنان, ولاية الخرطوم في الفترة من فبراير 2012م إلى أغسطس 2014م. سبع و أربعون خزعة و مسحة فموية تم أخذها من أطفال تتراوح أعمارهم بين الثالثة و الرابعة عشر من العمر و الذين قاموا بزيارة عيادات طب أسنان الأطفال وتم تشخيصهم اكلينيكياً بداء فرط التنسج الظهارى البؤرى، و من ثم تم إستخلاص الحامض النووي من الخزعات عن طريق مواد معملية جاهزة مخصصة لإستخلاص الحامض النووي من الأنسجة و بعد ذلك تم إجراء التحليل الأحيائي الجزئي ( التفاعل السلسلي لإنزيم البوليميراز). اما المسحات الفموية فقد صبغت بصبغة بابانيكولا. النتائج: وجد أن أحدى عشرة عينة (23.4%) كانت موجبة للأنماط الجينية منخفضة الخطر 6/11 و عشرين عينة (42.6%) موجبة للأنماط الجينية 13/32 و سبعاَ و عشرين عينة (57.4%) موجبة للأنماط الجينية مرتفعة الخطر 16/31/33/35/45/52/58/66. بينما لم تكن هناك اي عينات موجبة للأنماط الجينية 18/39/56/59 (0%). سبع و عشرون عينة (57.4%) كانت موجبة لأكثر من نمط جيني واحد. أكثر الأنماط الجينية التي وجدت في هذة الدراسة هي النمط الجيني 32 (ستة عشر عينة موجبة, 34%) يتبعه النمط الجيني 16 (اثنتا عشر عينة موجبة, 25.5%). الأنماط الجينية 31, 33, 35, 52, 58 و 66 وجدت في هذه الدراسة باستخدام تقنية التفاعل السلسلى لإنزيم البوليميراز بينما لم يتم ذكرها في الدراسات الأخرى المتعلقة بمرض فرط التنسج الظهاري البؤري. أما فيما يخص المسحات الفموية فقد تم أجراء صبغة بابانيكولا و وجد أن تسعاَ و عشرين عينة (80.5%) كانت موجبة للتحليل الأحيائي الجزئي (التفاعل السلسلي لإنزيم البوليميراز ) أظهرت في صبغة بابانيكولا خلايا تقعرية و خلايا فتيلية متعددة الأقطاب . النسبة المئوية لحساسية صبغة بابانيكولا كانت 78.4% بينما النسبة المئوية لخصوصيتها كانت 60%. الإستنتاج: إن معدل تكرار و نسبة الأنماط الجينية لفيروس الورم الحليمي البشري المصاحبة لفرط التنسج الظهاري البؤري كان (2.1% - 34%). نسبة المسحات الفموية الموجبة لصبغة بابانيكولا هي 76.6%. كان الفرق بين نتائج التحليل الأحيائي الجزئي ( التفاعل السلسلي لإنزيم البوليميراز ) و صبغة بابانيكولا مؤكد (مثبت) إحصائياً. وبهذا يكون التفاعل السلسلى لإنزيم البوليميراز هو الطريقة المرجعية (القياسية) لتشخيص داء فرط التنسج الظهارى البؤرى مقارنة بصبغة بابانيكولا. en_US

Files in this item

Files Size Format View

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Share

Search DSpace


Browse

My Account