University of Khartoum

Haemophilia A Carrier Detection in Sudanese Families with Haemophilia A using DNA Linkage Analysis Approaches

Haemophilia A Carrier Detection in Sudanese Families with Haemophilia A using DNA Linkage Analysis Approaches

Show simple item record

dc.contributor.advisor Eltahir Awad Gasim Khalil en_US
dc.contributor.author Elsheikh, Rayan Nasreldin Yousif
dc.contributor.other Molecular Biology en_US
dc.date 2014
dc.date.accessioned 2016-03-23T08:11:37Z
dc.date.available 2016-03-23T08:11:37Z
dc.date.issued 2016-03-23
dc.date.submitted 2016-03-23
dc.identifier.uri http://khartoumspace.uofk.edu/handle/123456789/19973
dc.description.abstract Background: Haemophilia A is the most common X-linked inherited bleeding disorder caused by a deficiency in the activity of coagulation factor VIII, with an incidence of 1 in 5000 male births. Genetic diagnosis of Haemophilia A is the most accurate method available for carrier detection. Direct mutation detection for haemophilia A is difficult and expensive, accordingly genetic testing for carrier detection has relied upon indirect linkage studies employing polymorphic markers of Factor VIII locus. Study design: This was a prospective, cross sectional, analytical and community-based study. Objective: This study aimed to investigate the usefulness of three intragenic DNA markers located in intron 18 [BclI restriction fragment length polymorphism (RFLP)], intron 13 and intron 22 CA repeats linkage analysis for carrier detection in Sudanese families. Materials & Methods: Following written informed consent 20 families with at least one subject affected with Haemophilia A, and 30 unrelated normal females as control group were enrolled. Polymerase chain reaction (PCR) and restriction enzyme analysis were used to study the polymorphism in BclI. Intron 13 and intron 22 CA repeats were analyzed using fluorescent PCR followed by capillary electrophoresis. Results: The incidence of BclI (+) allele was 78%, 39.5% and 33% in patients, female relatives and control group respectively. Expected heterozygosity for BclI was 0.48 in female relatives compared with 0.46 in the female control group. However, observed heterozygosity was found to be 0.54 in female relatives compared to 0.66 in the control group. The defective X chromosome was tracked in 13/20 (65%) mothers, hence 65% of the studied families were found to be informative using BclI-RFLP. Intron 13CA repeats were studied in 9 families. The defective X chromosome could be tracked down in 4/9 (44.4%) mothers. Intron 22 CA repeats were studied in 11 families and all families were uninformative. Conclusion: PCR-RFLP using BclI is informative in carrier detection of Haemophilia A in the Sudanese population. BclI is more informative compared to both Introns 13 and Intron 22 CA repeats. en_US
dc.publisher UOFK en_US
dc.subject Molecular biology en_US
dc.subject Hemophilia A - deoxy ribonucleic acid - Sudan en_US
dc.subject Hemophilia A - epidemiology en_US
dc.subject Hemostasis - FVIIL en_US
dc.subject FVIIL - gene structure en_US
dc.subject FVIIL- gene polymorphisms en_US
dc.title Haemophilia A Carrier Detection in Sudanese Families with Haemophilia A using DNA Linkage Analysis Approaches en_US
dc.type Thesis en_US
dc.Degree M.Sc en_US
dc.Faculty Medical Laboratory Sciences en_US
dc.description.arabic-abstract خلفية: نزيف الدم الوراثي من النوع (A) هو الخلل الأكثر شيوعاً في بين أنواع النزف الموروث المرتبطة بالكرومسوم X، هذا الخلل يسببه الإنحراف الوظيفي في أداء عامل التخثر الثامن، بنسبة حدوث 1 من كل 5000 من كل مولود ذكر. التشخيص الجيني لنزيف الدم الوراثي (A) هو الأسلوب الأكثر دقة المتاح لكشف حاملات الخلل الجيني. الكشف المباشر عن الطفرات لنزيف الدم الوراثي (A) صعب ومكلف ، وفقا لذلك اعتمدت الاختبارات الجينية للكشف عن حاملات الخلل الجيني على دراسات الربط غير المباشرة التي تستخدم مُوسمات متعددة الأشكال في موضع العامل الثامن. تصميم الدراسة: هذه دراسة إحتمالية مقطعية تحليلة مجتمعية. الاهداف: الهدف من هذه الدراسة التحقق من فائدة ثلاثة موسمات ( داخلية الجين) للحمض النووي، تتموضع في , Intron 13 and Intron 22 CA repeats) Intron 18 BclI) للتحليل الترابطي لكشف حاملات الخلل الجيني في الأسر السودانية. المواد و الطرق: شملت الدراسة 20 عائلة مع توفر شخص واحد على الأقل متأثر من نزيف الدم الوراثي(A) و 30 إناث طبيعيات لا علاقة لهن بالخلل الجيني كمجموعة تحكم. استخدمت سلسلة تفاعل البلمرة وتحليل الإنزيم التقييدي PCR-RFLP)) لدراسة تعدد الأشكال في BclI. Intron 13 and Intron 22 CA repeats)) تم تحليلها باستخدام (Fluorescent PCR & Capillary Electrophoresis). النتائج وجد حدوث BclI (+) أليل 78٪، 39.5٪ و 33٪ في المرضى، قريباتهم الإناث وفي مجموعة التحكم، على التوالي. تغاير الزيجوت المتوقع ل BclI 0.48 في القريبات الإناث مقارنة مع 0.46 في مجموعة التحكم من الإناث. ومع ذلك، وجد أن تغاير الزيجوت المراقب كان 0.54 في القريبات الإناث مقارنة مع 0.66 في مجموعة التحكم. وقد تم تعقب كرومسوم X المعيبة في 13/20 (65٪) من الأمهات، وبالتالي تم العثور على 65٪ من الأسر المدروسة لتكون مفيدة لاستخدام BclI RFLP. وقد درس Intron 13 CA repeats في 9 عائلات. ويمكن تتبع الكروموسوم X المعيبة عليها في 4/9 (44.4٪) من الأمهات. وقد درس Intron 22 CA repeats في 11 عائلة، ووجد أن جميع الأسر مبهمة. الخلاصة: أن تحليلBclI القائم على PCR كان مفيدا في الكشف عن حاملات الخلل الجيني لنزيف الدم الوراثي (A( في السودانيين. BclI هو أكثر غني بالمعلومات (65٪) مقارنة مع Intron 13 & Intron 22 CA repeats. en_US

Files in this item

Files Size Format View

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Share

Search DSpace


Browse

My Account