University of Khartoum

Phenotypic and Genotypic Identification of Bacterial Isolates on Sudanese Banknotes and their antibiotic Resistant Pattern

Phenotypic and Genotypic Identification of Bacterial Isolates on Sudanese Banknotes and their antibiotic Resistant Pattern

Show simple item record

dc.contributor.advisor Malik Suliman Mohamed Mustafa en_US
dc.contributor.author Ahmed, Noha Ahmed Abd Alfadil
dc.date 2017
dc.date.accessioned 2017-08-10T13:42:08Z
dc.date.available 2017-08-10T13:42:08Z
dc.date.submitted 2017
dc.identifier.uri http://khartoumspace.uofk.edu/123456789/25370
dc.description.abstract Background: Sudanese currency paper notes are highly handled article under a variety of personal and environmental conditions. They may be contaminated by antibiotic resistant pathogenic bacteria and serve as a vehicle for infectious diseases transmission. This study was conducted to identify bacterial isolates on Sudanese banknotes phenotypically and genotypically and to study the susceptibility pattern of the isolates towards commonly used antibiotics. Methods: This study was carried out using 135 samples of Sudanese currency notes of five different denominations {2, 5, 10, 20 and 50 Sudanese pounds}, which were collected randomly from hospitals, food sellers, transporters and banks in Khartoum, Bahri and Omdurman. The bacterial prevalence was determined using both culture-based techniques and 16S rRNA gene sequencing methods. The sensitivity patterns of isolates towards commonly prescribed antibiotics were performed using the Kirby- Bauer disk diffusion. Antibiotics resistant genes of some isolates were detected using PCR techniques. Results: All of Sudanese currency notes were found to be contaminated with different species of bacteria. The predominant Gram-negative bacterium found in the studied notes was Klebsiella pneumoniae (23%), whereas the most Gram-positive isolate was Bacillus mycoids (15%). There was a significant relationship between the number of isolates and the currency denomination with p-value < 0.05 (The lower denomination showed higher contamination level). All examined isolates were resistant to Penicillins except Proteus mirabilis, Serratia marcescens and Klebsiella oxytoca. However, some strains were found to be sensitive to Amoxicillin and Co-amoxyclav. The isolates were found to be sensitive to Cephalosporins except some strains of Klebsiella oxytoca, Coagulase negative staphylococci and Serratia marcescens were found to be resistant to Cefuroxime and Cephalexin. Macrolides (Erythromycin and Azithromycin) resistant strains were detected. All Staphylococcus aureus isolates were Methicillin and Vancomycin resistant. Furthermore, multi-drug resistant strainswere recovered and strains harboring resistant genes (CTX-M and TEM) such as Escherichia coli, K.pneumoniae, Enterobacter cloacae,Acinetobacter baumanii and Pseudomonas aeruginosa were detected in Sudanese currency notes. A total of 45 16S rRNA gene sequences determined in this study were deposited in NCBI to get accession numbers and 33 accession numbers were received. Conclusion: All studied Sudanese paper currencies were contaminated with pathogenic bacteria that may play a significant role in the transmission of bacterial infections. Some multi-drugs resistant strains were also detected. en_US
dc.publisher university of khartoum en_US
dc.title Phenotypic and Genotypic Identification of Bacterial Isolates on Sudanese Banknotes and their antibiotic Resistant Pattern en_US
dc.type Thesis en_US
dc.Degree M.Sc en_US
dc.Faculty Pharmacy en_US
dc.description.arabic-abstract الخلفية: العمله الورقية السودانية تعتبر أكثر الوسائطالتيتتبادلهاالأياديفيحياتنااليومية في مختلف البيئات والمجتمعات ،مما يزيد من إحتمالية تلوثها بالبكتريا الممرضهوالبكتريا المقاومه للمضادات الحيوية وتعتبر مسئوله من إنتشار الأمراض المعديه الخطيرهوما يترتب عليها من مشاكل إقتصادية. أُجريت الدراسة لتحديد التلوث البكتيري للعمله الورقية السودانية و دراسةإستجابة البكتريا المعزولة للمضادات الحيوية الشائع إستخدامها حالياً. الطريقة:الدراسه أُجريت علي 135 عمله نقدية سودانيةبفئات مختلفه) 5,10,20,50 جنيه) ومصادرمختلفة جُمعت من الخرطوم,أُمدرمان و بحري .تم تحديد هوية البكتريا المعزوله بإستخدام كلمن التقنياتالمعتمده علي التزريع ودراسة الخواص المظهريةphenotypic-based methods و عن طريق التسلسل الجيني للحمض الرايبوسي s rRNA gene sequencing methods)16 (, وتم تقييم مقاومتها للمضادات الحيوية بإستخدام تقانة الإنتشار من الأقراص المشبعه بالمضاد الحيوي المعني Kirby- Bauer disk diffusion)). بالإستعانة بتقنيات تفاعل سلسلة البلمرة PCR تم تحديد الجينات المسؤوله من المقاومة. النتائج: جميع العملهالورقية ملوثة بأنواع مختلفة من البكتريا الممرضة, كانت الكلبسيلا الرئوية Klebsiella pneumoniaeaأكثر البكتريا سالبة الجرام إنتشاراً بمعدل 23% بينما وجدت عصيات باسيللس الميكويدس Bacillus mycoidsهي الأكثر ظهوراً من بين البكتريا موجبة الجرام.وقد ظهرت علاقة مباشرة بين عدد البكتريا المعزولة و فئات العمله النقدية (p-value <0.05)فكانت القيم الأدني من العملات الورقية (2 و5 جنية سوداني ) هي الأكثر تلوثاً .كل البكتريا المعزولة وُجدت مقاومة للبنسلينات Penicillins ماعدا البكتريا المٌتقلبة الرائعةProteus mirabilis,السيراتيامارسيسنز, Serratia marcescens الكلبسيلا Klebsiella oxytoca والتي أظهرتبعض سلالاتها إستجابها للمضادين الحيويين Amoxicillin وCo-amoxyclav. معظم البكتريا المعزولة كانت حساسه للمضاد الحيويCephalosporinsبإستثناء بعضسلالات Klebsiella oxytoca,البكتريا الإيجابية للإنزيم المخثر Coagulase negative staphylococciوالسيراتيا مارسيسنزSerratia marcescens والتي وُجدت مقاومة للمضادين الحيويين Cefuroxime and Cephalexin.جميع سُلالأت البكتريا العنقودية الذهبيةأظهرت مقاومتهالكلاً من المضادين الحيويين Methicillin و Vancomycin كما تم عزل البكتريا متعددة المقاومه للمضادات الحيوية وفحص الجينات المسؤوله من المقاومةCTX-M و TEM لدي البكتيريا التي أظهرت مقاومة لأكثر من مضاد حيوي مثل سلالاَت الزائفة الزنجارية, P. aeruginosaالإيشيريشياتالقولونية E.coliالكلبسيلا الرئويةKlebsiella pneumonia, الراكدة البومانية baumanii Acinetobacterوالأمعائيه المزدرقيه. Enterobacter cloacae أربعه و خمسون عينة تم التعرف عليهابطريقة التسلسل الجيني للحمض الرايبوسي S rRNA gene )16( تم إرسالها الي المركزالعالمي لمعلومات التكنولوجيا الحيويه (NCBI) وتم الحصول علي رقم التعريف العالمي (Accession number) للبكتريا المعزوله من العملة السودانية ل33 عزله سودانية. الخلاصة:لقد توصلت الدراسة أن العملة النقديةالسودانيه ملوثه بالبكتريا الممرضة والبكتريا متعددةالمقاومةللمضاداتالحيويّة والمسئولة من إنتشار الأمراض البكتيرية بين المتداولين في المجتمع السوداني. en_US

Files in this item

Files Size Format View

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Share

Search DSpace


Browse

My Account