University of Khartoum

Detection of Plasmodium Falciparum resistance genes associated with Chloroquine and Fansidar in South Khartoum and Eastern-Sudan

Detection of Plasmodium Falciparum resistance genes associated with Chloroquine and Fansidar in South Khartoum and Eastern-Sudan

Show simple item record

dc.contributor.advisor Maowia M. Mukhtar en_US
dc.contributor.author Gism-Elseed, Linda Abbasher Mahmoud
dc.date 2018
dc.date.accessioned 2018-02-13T08:19:04Z
dc.date.available 2018-02-13T08:19:04Z
dc.date.submitted 2017
dc.identifier.uri http://khartoumspace.uofk.edu/123456789/26118
dc.description 77 Pages
dc.description.abstract Background: Drug resistance has been a major obstacle in malaria reduction. Plasmodium falciparum has shown an extraordinary ability to develop resistance to all antimalarial employed and implementing molecular markers for monitoring the drug resistance may be essential to overcome the problem. The overall aim of this study was to demonstrate the prevalence of drugs resistant coding genes in Plasmodium falciparum parasite in areas of marked seasonal and unstable malaria transmission in southern Khartoum and eastern Sudan. Material and Methods: The study has examined prevalence of 5 genes implicated in P.falciparumdrug resistance: the chloroquine resistance transporter (Pfcrt), dihydrofolatereductase(dhfr), dihydropteroate synthase (dhps) and multi-drug resistance (pfmdr-1) among parasite populations in Daraweesh village in eastern Sudan and in Mayo Camp in the capital Khartoum. Samples were collected form positive film malaria patients in day one before treatment and followed to the third day of treatment. Only patients with treatment follow up in the third day were included within the research. Twenty six blood samples from Daraweesh village and 66 samples from Mayo Camp were collected and examined for Pfcrt, Pf-mdr1, Pfdhfr and Pfdhpsgenes using PCR and DNA sequencing. Result: Chloroquine resistance genes (Pfcrtand Pfmdr1) showed consistent increase in frequencies in Mayo camp isolates. single and double mutant genotype (NLFWSND, YLYWSND, and YLFWSND) were detected in high prevalence in Pfmdr1 (P. value 0.03). Moreover, Pfcrtthe triple genotype were dominant (CVIET), and all isolates harbored mutation at codon 76T. 69.2% of Daraweesh village isolates carried single mutant genotype CVMNT in Pfcrt gene. Single mutant genotype in Pfmdr1 gene was found in low frequency YLYWSND while NLFWSND was in a high prevalence. 84.6% of the isolates carried the sensitive allele at 581A and 70% isolates carried the mutant allele at 437G and 540E at the dhpsgene in Daraweesh village, while in Mayo camp, 13.6% of the isolates harbored the mutant Alleles 436A\F, 60% of the isolates were mutant at 437G and (47%) isolates harbored the mutant allele 581G. The alleles 540K and 613A were wild in the all isolates. Dhfrin Daraweesh village the pyrimethamine resistance genotype (ICNI) was the highest and observed in 57.7% of the isolates. Double mutant IRSI and single mutant genotype ICSI were found in 7.7% and 11.5% of the isolates respectively. en_US
dc.publisher university of khartoum en_US
dc.subject Detection Plasmodium, Falciparum resistance ,genes associated,h Chloroquine, Fansidar in South Khartoum ,Eastern-Sudan en_US
dc.title Detection of Plasmodium Falciparum resistance genes associated with Chloroquine and Fansidar in South Khartoum and Eastern-Sudan en_US
dc.type Thesis en_US
dc.Degree M.Sc en_US
dc.Faculty Endemic Diseases en_US
dc.description.arabic-abstract خلفية: تشكل مقاومة العقار عقبة كبيرة في مكافحة الملاريا و قد اظهر الطفيل بلازموديوم فالسيبارم قدرة كبيرة على تطوير المقاومة ضد العقاقير التي استخدمت ضده وتعتبر متابعة العلامات الجزيئية المتعلقة بهذه المقاومة ضرورة لتخطي هذه العقبة. الهدف: أجريتهذهالدراسةبغرضاختبار مدى انتشارالمتصورةالمنجلية المقاوملعقاقيرالملاريا في المناطق التي تنتقل فيها الملاريا موسميا وغير مستقرة في جنوب الخرطوم وشرق السودان. المنهجية: تمت دراسة5جيناتتحددمدى إستجابة البلازموديوم لعقارالكلوروكوينوالفانسداروهي: جينناقلمقاومةالكلوروكوينPfcrt, جينثنائيالفوليتالمختزلDHFR, جينثنائيالبتيرويتDHPS, جين متعددالعقاقيرMDR1, و جين K13 propeller وسطمجموعتين من طفيل البلازموديوم في قرية دراويش شرق السودان و مخيم مايو جنوب الخرطوم. تم جمع العينات خلال دراسة مقعطعية شملت المرضى المصابين بالملاريا التي تم اثباتها بالمسحة المجهرية في اليوم الاول قبل العلاج و من ثم متابعتهم باخذ عينة في اليوم الثالث من العلاجو فقط العينات التي توبعت في اليوم الثالث تم ادراجها ضمن البحث,تم فحص 26 عينة من قرية الدراويش و 66 عينة من مخيم مايو للجينات: Pfcrt, Pfmdr1, Pfdhfr وPfdhps. النتائج: الجينات المسؤولة عن مقاومة الكلوروكين (Pfcrt وPfmdr1) أظهرت زيادة ثابتة في التردد في مخيم مايو. في جينPfmdr1 التركيب الوراثي المتحول المفرد والثنائي (NLFWSND، YLYWSND، وYLFWSND) شوهد في معدل انتشار عالي. وبالنسبة لجينPfcrt التركيب الوراثي الثلاثي كان المهيمن (CVIET)، وجميع العيناتاظهرت طفرة في T76. فيما يتعلق بقرية الدراويش، 69.2٪ من العيناتاظهرت متحول وراثي فردي في جينPfcrt (CVMNT) و تم العثور على التركيب الوراثي المتحول الفردي في معدل انتشار منخفضYLYWSND وكان NLFWSND في تردد عالي. وبالنسبة لجينDHPS84.6٪ من العزينات تؤوي أليلات حساسة للعقار في 581A و 70٪ العيناتحوت أليل متحولة في 437G و540E في قرية الدراويش، بينما في معسكر مايو، تؤوي 13.6٪ من العينات متحولة الأليلات 436A \ F، و 60٪ من العينات كانت متحولة في 437G و (47٪) من العيناتتحمل في 581G أليل متحولة. وكان الأليان الاثنان 540K و613 Aفي شكلها الطبيعي في جميع العينات. كان DHFR في قرية الدراويش مستوى التركيب الوراثي الدال على انخفاض المقاومة لعقارالبيريمثيامين (ICNI) أعلى ولوحظت في 57.7٪ من العينات. تم العثور على متحولة وراثىة مزدوج IRSI و ICSI في 7.7٪ و 11.5٪ من العينات على التوالي. وبالإضافة إلى ذلك، التغير في ترددات الجينات المقاومة للأدوية في العينات السابقة للعلاج و التالية للعلاج تم رصدها في عينات من قرية الدراويش. لم يلاحظ أي اختلافات كبيرة في الترددات بين يوم السابق للعلاج و اليوم الثالث من العلاج. وقد اثبتت هذه الدراسة أيضا عدم وجود الطفرات التي هي ذات صلة بمقاومة الأرتيميسينين في المتصورة المنجلية بجينKelch-13في عينات من خمس مناطق في السودان. وقد كانت العينات من قرية الدراويش ومعسكر مايو وكذلك أعالي النيل وكسلا والجزيرة. وقد تم الكشف عن خمس طفرات جديدة طفرة في عينات قرية الدراويش، أربعة كانوا (P475L، Y519 L \ F، V520F، P527A) و (N533H). وكانت جميع العينات من مخيم مايو وأعالي النيل وكسلا والجزيرة في شكلها الجيني الطبيعي ولم يلحظ وجود اي من الطفرات المتعلقة بمقاومة عقار الارتيميثنين المستخدم حاليا. en_US

Files in this item

Files Size Format View

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Share

Search DSpace


Browse

My Account