University of Khartoum

Phenotypic and Genetics Characterization of Three Baggara Zebu Cattle sub-types (Nyalawi, Rezeigi and Mesairi

Phenotypic and Genetics Characterization of Three Baggara Zebu Cattle sub-types (Nyalawi, Rezeigi and Mesairi

Show simple item record

dc.contributor.advisor Farouk Mohammed Elamin en_US
dc.contributor.author Hamouda, Maha Musa Mohammed
dc.contributor.other Genetics and Animal Breeding en_US
dc.date 2017
dc.date.accessioned 2019-09-14T12:34:46Z
dc.date.available 2019-09-14T12:34:46Z
dc.date.submitted 2019-09-08
dc.identifier.uri http://khartoumspace.uofk.edu/123456789/27118
dc.description 151 Pages
dc.description.abstract The objectives of this study were to investigate the phenotypic and genetic relationships of body conformation and the variations between and within Baggara zebu breed with its main three sub-types (Nyalawi, Rezeigi and Mesairi), the experiment was conducted at Animal Production Research Center at Helat Kuku, in the north eastern region of Khartoum state and DNA isolation and molecular analysis were carried out at the Molecular Biology Centre, Faculty of Medicine and the rest of the analysis was done on the Faculty of Medical Laboratory Science ALNeelain University, the animal ages of this study were according to incisor eruption between one to four years, they were selected randomly and they were fed normal concentrate and green fodder at lib, a measuring tape (cm) was used for all measurements of phenotypic characters and blood samples for molecular analysis were used, about 78 bulls (33 Nyalawi, 32 Rezeigi and 13 Measiri), body measurements including face length, ear length, horn length, neck length, hum height, hum circumference, withers height, height at hump tip, back height, back length , back length around hump, heart girth, heart girth around hump, body length, chest depth, barrel circumference, pelvic length and width, side length, dewlap length, dewlap width, tail length and body weight were taken from each animal. The data were analyzed using Statistical Package for Social Sciences (SPSS software), the mean and Standard error were 47.42±0.62, 21.03±0.37, 14.93±1.69, 35.08±0.9, 11.90±0.61, 25.61±1.05, 113.03±2.62, 121.19±1.65, 119.9±1.31, 71.24±2.39, 121.62±2.14, 139.39±7.42, 154.27±3.24, 123.89± 2.04, 53.27±0.78, 169.88±3.6, 27.57±0.45, 26.026±0.59, 102.46±1.17, 69.27±2.86, 19.6±1.81, 79.41± 1.51 in cm and 227.936±9.997 kg, respectively. Nyalawi sub-type was found to be high significantly (P<0.01), and superior over Rezeigi and Mesairi sub-types in body weight, the mean were 244.24±9.70, 222.00±15.58 and 217.31±10.09 kg, respectively. Heart girth and heart girth around hump were also significantly (P<0.01) greater for Nyalawi sub-type with mean values of 144.18 ±1.87 and 158.67 ±2.68 cm respectively, for Mesairi sub-types were 140.46±2.57and 153.54±3.46 cm respectively and Rezeigi sub-types 135.35±2.97, 150.61±3.58cm, respectively. From the result Nyalawi and Mesairi sub-types were superior in barrel circumference than Rezeigi sub-types, mean and standard error were 172.36±2.98 and 173.15±3.91 cm, respectively and for Rezeigi sub-type barrel circumference was 164.13±3.90cm. Determination of regression coefficient (R2) in Baggara zebu breed (Nyalawi, Mesairi and Rezeigi sub-types) were 0.71, 0.74 and 0.10, respectively. Correlation coefficients of heart girth, body measurements of the three sub-types of Baggara zebu beef cattle (Nyalawi, Mesairi and Rezeigi) were 0. 84, 0.86 and 0. 31, respectively, the correlation coefficient of height at withers, height at back and body weight were highly significant (P<0.01) on Mesairi and Rezeigi sub-types but it was not significant (P>0.05) in Nyalawi sub-types. However, the correlation coefficients of chest depth was highly significant (P<0.01) in Rezeigi and Nyalawi sub-types, but the same correlation in Mesairi sub-types was not significant (P>0.05).The second part of the study was molecular analysis, about sixty one blood samples of each animal (25 Nyalawi, 13 Mesairi, 23 Rezeigi sub-types) were collected from the jugular vein in vacutainer tubes, containing EDTA as anticoagulant and held at 4°C pending laboratory analysis for DNA extraction and molecular marker RAPD-PCR method, three primers were selected randomly, two of them were actively worked, the level of polymorphism among the three sub-types of Baggara zebu breed were 56.85%, and the level of polymorphism among the two sub-types of Baggara zebu breed (Nyalawi and Rezeigi) were 71.43%, but Mesairi sub-type was failed on the test by RAPD-PCR method. In conclusion, the results of linear body measurements of the phenotypic traits for the three sub-types of Baggara zebu breed showed more differences. Molecular variation between the two types Nyalawi and Rezeigi, this variation could be used for selection and breeding strategies in Baggara zebu breed, especially Nyalawi sub-type; However, genetic variation between the three sub-types of Baggara breed needs further investigation. en_US
dc.language.iso en en_US
dc.publisher University of Khartoum en_US
dc.subject Zebu Cattle; DNA; Animal Production Research Center en_US
dc.title Phenotypic and Genetics Characterization of Three Baggara Zebu Cattle sub-types (Nyalawi, Rezeigi and Mesairi en_US
dc.type Thesis en_US
dc.Degree Ph.D en_US
dc.Faculty Animal Production en_US
dc.description.arabic-abstract الهدف من هذه الدراسة هو التحقق في العلاقة بين الصفات الظاهرية والفرقات الوراثية بين و داخل الأنواع الثلاثة لأبقار البقارة (النيالاوى، الرزيقى والمسيرى) ، اجريت التجربة بمركز بحوث الإنتاج الحيواني بحلة كوكو شمال شرق ولاية الخرطوم. استخلاص الحمض النووي و التحليل الوراثى الجزيئي تم بمركز أبحاث الوراثة الجزيئية بكلية الطب وبقية التحليل تم بكلية علوم المختبرات (معمل أبحاث الأحياء الجزيئي) بجامعة النيلين .اعمار حيوانات هذه الدراسة حسب نظام سقوط الاسنان بين عمر سنة والاربع سنوات، تم اختيار عينات عشوائيا وتغذيتها بعليقة عادية وتم استخدام قياس متري (سم) وتقنية الواسمات الجزيئية فى هذا البحث لقياس صفات الجسم المظهرية وعينات الدم للقياسات الوراثية . بيانات الصفات الظاهرية التي استخدمت في الدراسة جمعت من (78) ذكر لأبقار البقارة ( 33 نيالاوى، 32رزيقى و 13مسيرى) ، حللت البيانات باستخدام نظام الحزم الإحصائية (SPSS ). قياسات الجسم تضمنت طول الوجه، طول الاذن، طول القرون، طول الرقبة، ارتفاع السنام وعرض السنام، الارتفاع من الارض، ارتفاع عن الارض والسنام معا، ارتفاع الظهر، طول الظهر، طول الظهر والسنام، محيط الصدر ومحيط الصدر حول السنام، طول الجسم، عمق الصدر، محيط البطن، طول وعرض الحوض، طول الجانب، طول وعرض اللبب، طول الذيل ووزن الجسم. وكانت المتوسطات والخطأ المتوسطى كالاتى: 47.42±0.62 ،21.03±0.37 ،14.93±1.69 ،35.08±0.9 ،11.9±0.61 ،25.61±1.05، 113.03±2.62، 121.19±1.65 ،119.9±1.31، 71.24±2.39 ، 121.62±2.14، 139.39± 7.42 ،154.27 ± 3.24 ، 123.89± 2.04 ،53.27± 0.78، 169.88±3.6، 27.57±0.45، 26.03±0.59 ،102.46±1.17، 69.27±2.86 ،19.6±1.81، 79.41±1.51 سم و 227.94 ± 9.99 كجم على التوالى. أوضحت نتائج البحث تفوق أبقار النيالاوى على أبقار الرزيقى والمسيرى في الصفات المظهرية مثل متوسط وزن الجسم الذي تراوح بين244.24±9.7، 222±15.58و 217.31± 10.09كجم على التوالي . كذلك أبانت الدراسة أن هنالك فروقات في متوسط محيط الصدر ومتوسط محيط الصدر حول السنام لأبقار النيالاوى والمسيرى والرزيقى 144.18±1.87و158.67±2.68 ثم 140.46±2.57 و 3.46±153.54 ثم 2.97 ±135.35و 3.58 ±150.61 سم على التوالي. ومن دراسة النتائج كانت هنالك تفوق فى قياس محيط البطن لأبقار النيالاوى والمسيرى على أبقار الرزيقى172.36±2.98 و173.15±3.91 و164.13±3.9 سم على التوالي .تقدير معامل الانحدار (R2) لسلالة ابقار البقارة (نيالاوى, مسيرى والرزيقى) كانت كالتالي 0.71 ،0.74 و0.10 على التوالي ومعدلات الارتباط لقياس محيط الصدر وقياسات الجسم للأنواع الثلاثة لأبقار البقارة (نيالاوى ومسيرى ورزيقى) كالاتى: 0.84و0.86 ثم 0.31 على التوالي و كانت معدلات الارتباط بين الارتفاع عن الأرض والارتفاع عند الخلفية ووزن الجسم ذات درجات معنوية عند المستوى (P<0.01) خاصة أبقار المسيرى والرزيقى، لكن ليس لها تأثير معنوي في أبقار النيالاوى (P>0.05), أما معدل الارتباط لعمق الصدر فكان له تأثير معنوي في أبقار الرزيقى والنيالاوى (P<0.01) ولكنه ليس له تأثير معنوي في أبقار المسيرية (P>0.05). اما الجزء الثانى من الدراسة فكان التحليل الوراثى ، حوالي (61) عينة دم من كل حيوان (25 النيالاوى، 13 المسيرى و23 الرزيقى) أخذت من الوريد الوداجى ووضعت في أنابيب بها مادة مضاد للتخثرEDTA ونقلت في درجة حرارة 4° مئوية لحين استخلاص الحمض النووي والتحليل عن طريق تقنية الواسمات الجزيئية (تقنية تضاعف تعدد مظهر الحمض النووي المنزوع الأكسجين) RAPD-PCR باستخدام ثلاثة بادئ اختيرت عشوائيا اثنبن فقط من البادئات اعطت نتائج. التباين في معدل تعدد المظاهر الوراثية بين الأنواع الثلاثة لأبقار البقارة كانت 56.85 % في حين أن التباين في تعدد مظهر الحمض النووي المنزوع الأكسجين بين نوعى ابقار النيالاوى والريزيقى كان 71.43%. ، اما أبقار المسيرى لم تظهر اى نتائج عند استخدام الواسمات الجزيئية العشوائية. خلصت الدراسة ان قياسات أطوال الجسم للصفات المظهرية على الأنواع الثلاثة لأبقار البقارة التي أظهرتها النتائج هنالك اختلافات بين الانواع الثلاثة موضوع الدراسة وكذلك اختلاف في درجات تعدد المظاهر الوراثية بين النوعين النيالاوى والرزيقى . يمكن استخدام هذه الاختلافات لابقار البقارة في استراتيجيات التربية وبرامج الانتخاب خاصة أبقار النيالاوي ، و الاختلاف الوراثي بين الأنواع الثلاثة لأبقار البقارة يحتاج لمزيد من البحث. en_US

Files in this item

Files Size Format View

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Share

Search DSpace


Browse

My Account