University of Khartoum

Genotypic and Phenotypic Methods for Detection of Methicillin Resistant Staphylococcus aureus

Genotypic and Phenotypic Methods for Detection of Methicillin Resistant Staphylococcus aureus

Show simple item record

dc.contributor.author Elradi, Amel Hassan Ahmed Zaroug
dc.date.accessioned 2019-09-14T12:43:29Z
dc.date.available 2019-09-14T12:43:29Z
dc.date.issued 2017
dc.identifier.uri http://khartoumspace.uofk.edu/123456789/27120
dc.description 69 Pages
dc.description.abstract Back ground: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is a global public health problem. MRSA strains are frequently resistant to different class of antibiotics. Multi drug resistance among MRSA is a matter of concern for professional health workers worldwide. Therefore, an accurate detection of MRSA in microbiology laboratory is essential and of high value for patient management and epidemiological purpose including hospital infection control. The present study was undertaken to compare various phenotypic methods including antimicrobial resistance tests (oxacillin disc diffusion, Cefoxitin disc diffusion and E-test Minimum Inhibition Concentration (MIC) oxacillin for detection of MRSA), comparing to the Genotypic methods by using Polymerase Chain Reaction (PCR) technique as gold standard method. Materials and Methods: One hundred strains of S. aureus clinical isolates were used in the study. PCR for the presence or absence of the mecA gene and routine antibiotic susceptibility testing were performed including oxacillin (1µg), Cefoxitin (30µg), Amoxicillin (25µg), Erythromycin (15µg), Cefotaxime (30µg), E-test MIC oxacillin. All the isolates were tested for antibiotic susceptibility testing using kirby bauer disc diffusion method against a predefined panel of antimicrobials, and interpretation was done according to Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) guidelines. Results: Out of the 100 Staphylococcus aureus clinical isolates, 40 mecA gene positive and 60 mecA gene negative by PCR. Cefoxitin (30µg) disc diffusion test showed 97.5% sensitivity and 100% specificity while Oxacillin (1µg) disc diffusion test showed 92.5% sensitivity and 100% specificity. The resistance percentage of MRSA isolate to Amoxicillin (25µg), Erythromycin (15µg), and Cefotaxime (30µg) was 92.5%, 82.5%, 90% respectively. E-test MIC oxacillin showed 92.5% sensitivity and 100% specificity. Conclusion: Results of Cefoxitin disc diffusion test is in concordance with the PCR for mecA gene. Thus, the test can be an alternative to PCR for detection of MRSA in resource constraint settings. en_US
dc.language.iso en en_US
dc.publisher University of Khartoum en_US
dc.publisher University of Khartoum
dc.subject Resistant Staphylococcus aureus; Oxacillin disk diffusion test; Agar disc en_US
dc.title Genotypic and Phenotypic Methods for Detection of Methicillin Resistant Staphylococcus aureus en_US
dc.type Thesis en_US
dc.Supervisor Baha Eldin Khalid Elamin
dc.description.arabic-abstract الخلفية: المكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثيسلين (م.ر.أس.أ) هي مشكله صحيه عامة عالمية. وكثيرا ما تكون (م.ر.أس.أ) مقاومة للمضادات الحيوية. تعدد مقاومة دواء مضادات الميكروبات ما بين(م.ر.أس.أ) يشكل هما وقلقا علي العاملين في مجال الصحة المهنية في جميع انحاء العالم. ولذلك ؛ الكشف الدقيق (م.ر.أس.أ) في معمل الاحياء الدقيقة ضروري وذات قيمة عالية لإدارة المرضي والاوبئة وبما في ذلك السيطرة علي العدوي بالمستشفيات. هذه الدراسة قامت بمقارنة مختلف الاساليب الوصفية بما في ذلك اختبارات مقاومة مضادات الميكروبات (نشر القرص اوكسثيلين ,نشر القرص سيفوكستين ) وإختبار (إ) لتركيز الحد الادني لتثبيط اوكسثلين للكشف عن (م.ر.أس.أ) مقارنة بالأساليب الجينية باستخدام طريقة ( تفاعل البلمرة المتسلسل ) وإستخدامه كأسلوب المعيار الذهبي. منهجية البحث: مئة سلالة من المكورات العنقودية الذهبية المعزولة سريريا، التي استخدمت في الدراسة .أختبرت بواسطة تفاعل البلمرة المتسلسل لوجود او غياب الجين ميغ أ (طريقة المعيار الذهبي ) والاختبار الروتيني لحساسية المضادات الحيوية تضم الاوكسثيلين (١مغ) سيفوكستين (٣٠مغ) اموكسيثلين (٢٥مغ) الايرثرومايثين (١٥مغ) سيفوتاكسيم (٣٠مغ) ،اختبار إ لتركيز الحد الادني لتثبيط اوكسيثلين . كل العينات المعزولة تم اختبارها لحساسية المضادات الحيوية بطريقة كيربي بير لنشر القرص المحددة مسبقا في الجدول لمضادات المكروبات وتفسيرها وفق معهد المعايير السريرية والمختبرية. النتائج: من بين ١٠٠ من المكورات العنقودية الذهبية المعزولة سريريا ؛٤٠ منها إيجابية للجين ميغ أ و٦٠ منها سلبية للجين ميغ أ بواسطة تفاعل البلمره المتسلسل. في إختبار نشر القرص السيفوكثيتين (٣٠مغ) أظهرت حساسية ٥,٩٧% وتحديد ١٠٠%. بينما في اختبار نشر القرص الاوكسيثلين (١مغ) أظهرت حساسية٥,٩٢% وتحديد ١٠٠%. النسبة المئوية لمقاومة (م.ر.أس.أ) الاموكسيثلين (٢٥مغ) ؛الايرثرومايثين (١٥مغ) سيفوتاكسيم (٣٠مغ) كان ٥,٩٢% ؛٥,٨٢% ؛٩٠% علي التوالي . إختبار إ لتركيز الحد الأدنى للتثبيط اوكسيثيلين أظهرت حساسية ٥,٩٢% وتحديد ١٠٠ % . الخلاصة: تتوافق نتائج اختبار نشر القرص سيفوكسيتين مع اختبار تفاعل سلسلة البوليمرات. وهكذا يمكن ان يكون الاختبار بديل لاختبار سلسلة البوليمرات في اعدادات مصارد القيد

Files in this item

Files Size Format View

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record

Share

Search DSpace


Browse

My Account